В автоматическом режиме работы блок управления поддерживает требуемую температуру уставки в салоне. Температура уставки может быть выбрана как автоматически, так и вручную.

• Автоматический выбор температуры уставки осуществляется на основании показаний датчиков температуры наружного воздуха. Далее, в соответствии с санитарными нормами, вычисляется требуемая температура уставки. 
• Также, температура уставки может быть выбрана вручную с панели управления БУК. Диапазон изменений температур уставки от 10 до 30 ºС

 БУК автоматически выбирает необходимый режим работы (отопление, кондиционирование или вентиляция) по следующим условиям:

• При температуре наружного воздуха ниже 15 ºС включается отопление
• При температуре наружного воздуха выше температуры уставки на 2 ºС, включается кондиционирование
• При температуре в салоне выше температуры уставки, включается кондиционер
• При температуре в салоне ниже температуры уставки, включается отопление
• Особое внимание заслуживает алгоритм переключения режима в процессе работы. Этот алгоритм будет описан позже.

В автоматическом режиме работы алгоритм управления вычисляет требуемое управляющее воздействие (нагревать или охлаждать) по алгоритму ПИ регулятора (условно, чем больше отклонение температуры в салоне от температуры уставки, тем больше требуется нагревать или охлаждать).  Затем:

• В режиме отопления, вычисляется требуемая температура воздуха, подаваемого в салон. Затем, требуемая температура сравнивается с текущей температурой подаваемого воздуха и, на основании этого сравнения вычисляется требуемый уровень мощности нагрева (0, 1, 2 или 3). 
• Если же это режим кондиционирования, то вычисляется требуемая мощность охлаждения (0, -1 или -2).

Значение мощности нагрева или охлаждения определяется отдельно для каждого тамбура и соответствует следующим значениям:

• -2 - включены 2 компрессора
• -1 - включен 1 компрессор
• 0 - нет нагрева или охлаждения
• 1 - 8кВт (включен КО1 или КО5)
• 2 - 16кВт (включен КО3 или КО6)
• 3 - 24кВт (включены КО1 и КО3 или КО5 и КО6)

Текущее значение мощности отображается в крайнем правом разряде дисплея БУКа.

Алгоритм перехода из режима отопления в режим кондиционирования и обратно.

 Если в данный момент система работает в режиме "отопление", то для перевода в режим "кондиционирование" должно быть выполнено следующее:

• уровень мощности двух тамбуров должен быть равен 0
• температура в салоне должна быть выше температуры уставки достаточно длительное время (В данном случае, учитывается произведение отклонения от температуры уставки и времени. То есть, чем больше отклонение, тем меньше времени требуется для переключения режима работы)
• затем включается таймер переключения режима (примерно 4 минуты)
• Во время работы таймера проверяется соблюдение предыдущий условий. Если условия не соблюдаются, то работа таймера прекращается и система переходит в режим "отопление"
• Если работа таймера завершена, то наступает черед перевода заслонки "зима-лето". Для этого, сначала полностью закрываются заслонки рециркуляции и наружного воздуха и открывается заслонка вентиляции тамбура. Затем, заслонка "зима-лето" переводится в противоположное положение. Затем закрывается заслонка вентиляции тамбура и открываются заслонки наружного воздуха.
• После того, как заслонка "зима-лето" переведена, включается режим "кондиционирование"

Переход из режима "кондиционирование" в режим "отопление" рпоисходит аналогично.